遗传，发育和进化是生命科学中的基本问题。探索发育调控机制起源和进化的规律，研究发育系统在进化进程中的变化和作用，并进而从分子水平阐明进化与发育的内在关联是进化发育生物学面临的重要挑战。另一方面，干细胞因其具有自我更新和多向分化的能力，在生物医学研究中具有广阔的应用前景，其增殖和分化机制的研究长期以来是生命科学中的热点和难点。本项目中，我们计划将小鼠和果蝇分别作为脊椎动物和无脊椎动物的代表，以它们的干细胞分化系统作为描述动物细胞分化发育的模型，研究干细胞相关基因的起源、突变和进化模式以及干细胞分化系统在进化中的变化和作用。我们还将从进化基因组学的视角，通过研究染色质组分结构，基因排布，修饰特征和进化模式的关系探索干细胞分化的表观遗传学机制。此项研究有望为理解发育机制多样性的起源和演化提供新的线索，并为研究干细胞分化机制以及基因组结构同功能的关系提供新的视角。