预备试验的结果表明太湖流域水稻地方品种资源蕴含着丰富的遗传变异，具有极大的研究价值。本研究拟选用12个水稻淀粉合成基因的21个基因内部标记以及与控制稻米蒸煮和食用品质性状的QTL紧密连锁的分子标记，检测太湖流域897份水稻地方品种的标记基因型，并结合品质性状的表型：（1）重点挖掘每个位点上不同的等位基因，进而确定各标记位点组合而成的各种基因型；将所有的标记基因型进行分类，整理出897份材料所测位点的基因型数据资料，明确品种间等位基因差异以及不同基因型品种米质的差异，通过关联分析确定基因的功能并寻找最优等位基因。（2）进行基因多样性相关参数的计算并构建897份材料的系统发生树，明确太湖流域水稻地方品种群体的结构和分化，揭示太湖流域粳稻和籼稻的品质性状在亚种间和亚种内的遗传差异。.研究结果可为保护稻种基因资源的多样性，充分利用优质基因，培育品质更为优良的水稻品种奠定基础。

太湖流域水稻地方品种资源蕴含着丰富的遗传变异，具有极大的研究价值。本研究选用19个水稻淀粉合成基因的23个基因内部标记，检测太湖流域897份水稻地方品种的标记基因型，并结合品质性状的表型：（1）挖掘每个位点上不同的等位基因，进而确定了各标记位点组合而成的各种基因型；将所有的标记基因型进行分类，整理出地方品种资源所测位点的基因型数据资料，明确品种间等位基因差异以及不同基因型品种米质的差异，通过关联分析进一步寻找与品质性状有关的标记并确定其作用的相对重要性。（2）进行基因多样性相关参数的计算并构建地方品种资源的系统发生树，明确太湖流域水稻地方品种群体的结构和分化，揭示太湖流域粳稻和籼稻的品质性状在亚种间和亚种内的遗传差异。研究结果可为保护稻种基因资源的多样性，充分利用优质基因，培育品质更为优良的水稻品种奠定基础。