本项目拟研究破碎化生境中大熊猫的扩散模式及其形成原因。计划选择大熊猫栖息生境破碎化最为严重的相岭山系为研究区域，应用景观遗传学（Landscape genetics）的原理和方法，以地理信息系统、线粒体DNA和微卫星分子标记为研究手段，从个体和种群两个层次上解决以下几个主要问题：（1）相岭山系大熊猫栖息生境破碎化的程度；（2）相岭山系大熊猫种群的遗传多样性现状和遗传结构模式；（3）相岭山系各破碎化生境中大熊猫的扩散模式；（4）相岭山系景观或环境特征与大熊猫遗传结构和扩散模式的相关性。通过以上研究，阐明破碎化生境中大熊猫的扩散模式及其形成原因；探讨大熊猫从肉食进化到素食、从一雄多配制进化到混交制的过程中，在扩散行为上采取了怎样的进化稳定对策，以及在扩散行为上怎样适应不断破碎化的栖息生境；进而验证和发展迁移和扩散理论，为大熊猫保护区的设计、廊道的建设和大熊猫的野外放归提供科学依据。

景观特征会影响物种的种群遗传结构和基因流。我们利用9个微卫星位点和非损伤性遗传取样方法，检测了景观特征(包括河流和公路）是否对相岭山系大熊猫的种群遗传结构和基因流造成了影响。结果发现：（1）大渡河和108国道严重限制了大熊猫的迁移扩散和基因流；（2）小相岭山系的大熊猫孤立种群发生过严重的种群崩溃事件，这一崩溃事件大约发生在250年前，使小相岭山系的大熊猫种群缩小了近60倍；（3）小相岭山系大熊猫的扩散模式是偏雄扩散。这些研究结果支持“景观特征会影响物种的种群遗传结构和基因流”的理论假设。