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阳虚质遗传学基础的SNP基因分型芯片研究

阳虚质遗传学基础的SNP基因分型芯片研究
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  • 批准号:81072715
  • 批准年度: 2010年
  • 学科分类:脏腑气血津液体质(H2701) |
  • 项目负责人:姚实林
  • 负责人职称:编审
  • 依托单位:安徽中医药大学
  • 资助金额:33万元
  • 项目类别:面上项目
  • 研究期限:2011年01月01日 至 2013年12月31日
  • 中文关键词: 阳虚质;遗传学;SNP;基因分型;芯片
  • 英文关键词:Yang-deficient constitution;single nucleotide polymorphism;copy number variation;;

项目摘要

中文摘要

阳虚质是体内阳气不足、以虚寒现象为主要特征的体质状态。阳虚质影响发病和证候倾向性以及发病后的疾病转归。对阳虚质进行正确辨识有助于制定个体化的治疗策略及养生保健措施。基于"阳虚质的成因主要与遗传因素有关,阳虚质表型是受多基因调控的"这一关于阳虚质成因的认识,本研究拟延续以前阳虚质外周血基因表达谱的基础研究,采用北京中医药大学王琦教授研发的中医体质量表V2.0版筛选典型的阳虚质受试者,并以平和质为对照,采用Affymetrix公司SNP 6.0基因分型芯片在人类全基因组水平上探寻阳虚质与平和质相比较而存在的SNPs和CNVs,进而观察这些SNPs和CNVs与以前发现的阳虚质差异表达基因存在什么关联性,并拟对存在SNPs和CNVs的阳虚质易感基因采用RT-PCR方法进行验证。本项目的实施,将有助于探寻到阳虚质的遗传标记,为中医体质学说的"禀赋遗传论"提供遗传学依据。

结题摘要

阳虚质是体内阳气不足、以虚寒现象为主要特征的体质状态。阳虚质影响发病和证候倾向性以及发病后的疾病转归。对阳虚质进行正确辨识有助于制定个体化的治疗策略及养生保健措施。基于“阳虚质的成因主要与遗传因素有关,阳虚质表型是受多基因调控的”这一假说,采用病例对照研究的方法,按《中医体质分类与判定》标准纳入阳虚质者和平和质者各30例,提取外周血白细胞DNA,由北京博奥生物有限公司采用SNP 6.0基因分型芯片检测阳虚质者和平和质者的SNP和CNV。全基因组关联分析结果显示,在等位基因模型、基因型模型、显性模型和隐性模型中,共有42个SNPs与阳虚质显著关联(Fisher确切概率法P值<10-4),这些SNPs的最近基因主要有RGS6、mGluR5、GAPDHL19、IKZF1等20余个。初步显示RGS6、mGluR5、GAPDHL19、IKZF1等的多态性分别与阳虚质体内cAMP、cGMP水平的变化,阳虚质的记忆力,阳虚质的能量代谢状况,阳虚质的免疫功能等存在某些关联。PennyCNV软件分析结果显示,平和质组平均CNV数为(12.63±3.39),最小值为8,最大值为20;去掉2个异常值后,阳虚质组平均CNV数为(15.04±8.95),最小值为2,最大值为38。从28个阳虚质样本中共鉴定出26个拷贝数变异区域(copy number variation region, CNVR),其中有19个增加型CNVR、6个删除型CNVR、1个混合型CNVR。大多数CNVR仅被少数阳虚质受试者共有,仅7个CNVR被不少于5个阳虚质受试者共有。阳虚质特异的CNVR所包含的代表基因功能涉及细胞内外信号转导、代谢调节、免疫反应等。本研究表明,阳虚质具有多基因遗传的特点,SNPs和CNVs是阳虚质的主要遗传标记,这为中医体质学说的“禀赋遗传论”提供了遗传学依据。本研究在中医兼夹体质的分析方面,采用交叉表法分析两种体质的兼夹情况,采用三进制代码分析3种以上体质的兼夹情况,具有一定的创新性。

评估说明

    国家自然科学基金项目“阳虚质遗传学基础的SNP基因分型芯片研究”发布于爱科学iikx,并永久归类于相关科学基金导航中,仅供广大科研工作者查询、学习、选题参考。国科金是根据国家发展科学技术的方针、政策和规划,以及科学技术发展方向,面向全国资助基础研究和应用研究,发挥着促进我国基础研究源头创新的作用。国科金的真正价值在于它能否为科学进步和社会发展带来积极的影响。

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