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PubMed文献检索详细教程

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  本文详细综述了PubMed文献检索详细教程,包括第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述,第二章 PUBMED简单检索技巧,第三章 PUBMED简单检索实例,第四章 PUBMED高级检索技巧,第五章 PUBMED高级检索技巧实例,第六章 谈MeSH Browser(医学主题词浏览器),推荐给大家。

  第一章 进入PubMed魔法学校--PubMed 概述

  有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。

  我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。

  尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。

  俗话说,喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢?

  PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文,有时甚至是免费的,这样,我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了(关于如何获取全文将在以后的章节中详述)。

  进入PubMed的主界面后, 首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。

  这是PubMed的核心部分。大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details键)即可完成。

  在主界面的左侧框(如上图),有:

  · Journal Browser 期刊浏览

  · MeSh Browser可以用它来分层流览MeSH表

  · Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。

  · Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。

  · Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。

  · Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式)

  3) Related Resources

  · Order Documents可以使用户在当地得到文献的全文, 但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。

  · Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。

  · Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。

  · Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。

  利用左侧框的这些服务,我们不仅能够进行功能更加强大的检索,而且还能得到不少非常有用的服务。这些都将在后续章节中介绍。

  总体而言,PubMed的界面相当简洁清晰,几乎是傻瓜式的。

  然而傻瓜式的界面并不意味着傻瓜式的操作。我看到很多人用了几年的PubMed,还是只知道在检索框里输入一个关键字,然后按一下"Go"按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况,这样的操作就足以得到令人满意的信息,但对于另一半情况,就没有那么幸运了,要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的"无用"信息中,要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。

  令人费解的是,很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间,却不愿花上几个小时的时间去认真研究一下PubMed。"君欲善其事,必先利其器", PubMed就好像一把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。

  在以后的章节中,我们将逐步深入地了解PubMed,相信通过这些章节的学习,我们可以真正熟练掌握PubMed,从而使自己的工作事半功倍。

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参考文献

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